Applied Mathematical Seminar40: Dimensionality reduction, clustering, and annotation for spatial transcriptomics data

Seminar| Institute of Mathematical Sciences

Speaker: Xingjie Shi, East China Normal University

Abstract: 空间转录组技术已成为在组织微环境背景下研究生物医学问题的重要工具。近年来，大规模高通量的空间转录组学数据的分析方法研究成为生物统计学和计算生物学领域的重要课题。本报告将介绍我们基于马尔科夫随机场(MRF)和概率PCA模型发展的降维、聚类和标注方法，以及在相关生物医学研究中的应用。